我所在的工程机械是一个成立较晚的专业，当时我找到了曾经留苏的学长杨红旗合作，他是机械部工程机械司副司长，后来又兼任工程机械协会的理事长，我们过去就与他合作频繁，早已是很好的朋友。现在他来兼任教授工作，也会提出比较切合实际的课题，或者通过他自己的关系联系一些工厂与学校合作，专业上有些课题就是在他的帮助下，一起指导研究生的。有时我们希望能从别处筹集一些研究项目的资金，他也会尽力帮助学校。
另外，校内还有一位与我长期合作的老师，叫做刘士贤，学校第一届研究生，就是由我、刘士贤和田崇记三个人负责招生的。其实在研究生部成立之前，国家在水利水电方面还是培养过少量的专业人才，我是作为第一批留苏的人员，进行水利水电专业的系统学习，经过6年的学习，我们这些人回国后分散到祖国的各个地方，才逐渐形成国家水利水电的初期基础。经过“文革”的10年停滞时期，研究生部的初次成立，也真正打开这些方面的人才培养计划。
当时我第一次带研究生，身为研究生部主任自是更应该在这些方面做出成绩，经过谨慎的选题环节后，我们找来许多课题参考资料，在准备工作上做出了许多努力。当时定出的选题是动力换档变速箱，此时有关部委和部队的研究所也在进行这方面的研究。而我手中的一些原版参考书对选题还是有一定帮助的，具有一定参考价值，所以我就把这些书全部翻译过来。然后开始从中研究，当时我们发现苏联的这套动力换挡变速箱的设计，还是有很多地方需要改进，便带着学生逐一进行修改，并把这些编写成研究生的指导书。但是有些程序是我们设计的，里面包含着新的方法和理论，其可行性需要进一步研究。
1980年暑期，我趁着家人回到青岛的岳父家，独自一个人留在北京。利用这段空档的时间，借了一个手摇的计算器，费力地把这些新方法从头到尾手算了一遍，设定相关参数，看这些程序是否可以贯穿下来。三伏酷暑，在没有空调和电扇的家中，全身如泼了水般地往下流着汗水，我一个人光着膀子一边擦着额头上的汗，一边反复进行测算。经过很长时间的校对，我才放心地把最终的结果交给研究生，让他们再次进行可行性验证，看是否需要改进。当时我、刘士贤和田崇记三个人带一位叫做严大考的学生（现任华北水利水电学院院长），后来又招来了几位学生，我们在做这个项目的研究时，请了杨红旗司长来帮忙联系到黄河工程机械厂去做实地实验，在杨司长的力荐下，工厂的人员都十分配合，提供了相应的实验车、电测车等6台大型机器，半个月的实验时间，总的成本是十分高的，这对于新项目是十分幸运的事情。
当时，我对自己所带的研究生要求十分严格，对于自己所做的新项目，也力求做到最好。而后我除了现场试验还要求进行室内实验，因此又请来杨司长跟宣化工程机械厂进行沟通，希望他们可以提供一个逼真的大型机器模型，同时在学校的空地上临时盖了实验用的房子。做完实验后，对现场和室内的两个方面进行反复分析，最后推导出公式，这才有了最终相对准确的选题论文。这在当年都是十分奢侈的事情，但是于我而言，科研试验和教学是我必须负责到底的事情，不能有丝毫的马虎与懈怠。
当年工程机械专业因为是新专业的缘故，我们组织了一批很有实力的教师资源，刘士贤、田崇记，还请来了北京的茅承觉、周克法、钱仲良、李绮鹏。因为大型机器的实验都需要电测，电测方面请了沈镇宇、沈连福、邱孝宝这几位正副教授来指导，还从邯郸请来曹庭驹、徐金门、宋德维、杨景章等教授短期协助。总之我们使出了各自浑身的力量，为工程机械专业的茁壮成长，竭忠尽智。
研究生部取得的成绩
1991年3月23日，答辩员们与毕业生在北京的研究生部合影
（答辩员前排左起：南新旭、杨红旗、刘士贤、钱仲良；毕业生后排左起：王强、祝庆、杨志明、宋广杰、耿守军、王宝森）
到我退休前，我主招和合作招收的工程机械专业的研究生一共有二十多名，他们毕业后经常与我保持联系。其实他们就像我在外的孩子，会时不时地回来看看父母，例如严大考、许波、刘子豪、冷波、杨志明、姜国桥、王强、郭素、祝庆、黄映辉、耿守军、霍梅春，还有一些是已经出国的。有些学生在国外发展得也不错，学生柴立从美国被派回国发展，现在中关村负责一个软件公司的总业务，经常在总公司和分公司两头跑，有时还经常给我带些自备的药品。
1988年，身穿导师服的南新旭（右）与毕业生祝庆（左）在北京的研究生部合影
2009年，南新旭的学生柴立在北京分公司留影
1989年，南新旭（左）在北京的研究生部给毕业生姜国桥（右）颁发毕业证书
20世纪80年代，南新旭（中）与毕业生吴宝燕（右）、郭金如（左）在研究生部办公楼前合影
这些研究生在学习期间一直与我们有着密切的关系，不像现在的老师一带学生就是一二十个，对每个学生都不是很熟悉，当年我们带学生是两三个老师带一个学生或是两个学生，这样才能够把自己的所学倾囊相授，让学生自身的知识基础能够打得更牢固。1995年我从北京水利水电管理干部学院退休，自此不再从事教学工作。截止到2001年学校并入北京工业大学之前，北京的研究生部一共招收了333名研究生，另外水利科学研究院主招了一百多名学生，都是水科院自己培养的研究生，其主要目的是充实水科院自身的科研力量。毕业的学生一般会被留校，有的当了所长，有的成为所里的技术骨干。在我们这些研究生里，有的也十分突出，比如水利部部长陈雷，为正部级别，另外还有八个司级的干部。
2000年，南新旭、刘士贤夫妇与毕业生们合影
（前排左起：刘士贤的妻子、南新旭、刘士贤；后排左起：王强、刘子濠、严大考、许波、冷波）
在科研方面，我们与北京工业大学合并前，已经有五十多项科研成果，其中国家级别奖励有六项。带研究生和搞科研的同时，也锻炼了所有教职工的教学水平。截至2001年，研究生部有31位教师被评为教授职称，还有的老师在不同的领域也做出了比较突出的贡献。学校知名的教授有陈肇和、田园、王正宏、施钧亮、窦以松、段昌国、黎宝昆、徐慰祖。
在举办研究生部的同时，我们在北京水利水电学院内设立了一个水利水电函授学院，名字叫做北京水利电力函授学院，由我兼任院长一职，马奇光、戴步生、郭孝纯三人任副院长。函授学院有专门属于自己的一套教师队伍，这些老师几乎是从参加工作就在搞函授教学，每个人都很有实际经验。学校在全国招收了几千名水利系统的函授生，这些学生在毕业后，都担任了更加重要的技术工作。另外，我们还建立了外语培训中心，一些打算出国的年轻人，会到我们这里接受专业的外教授课，取得了很好的学习效果。
筹办北京水利电力经济管理学院
1983年9月，水利电力部有过两次变动，第一次是在我们学校成立研究生部后，原先的水利和电力两个部就合二为一，统称为能源部。同时能源部在北京成立了北京水利电力经济管理学院，院长高之梁，党委书记是石蕴山，副书记是彭淼，副院长有我、李正、谭方正，后来又补来了一位叫做崔景才的副院长。